Kegiatan ekstra kurikuler atau kegiatan lain yang bersifat pengembangan akademis di MA Soebono Mantofani juga dilaksanakan, biasanya outdoor, hal ini dimaksudkan untuk memperkaya teman dan bersosialisasi dengan masyarakat sekolah. Selain itu, kegiatan-kegiatan non-kurikuler dimaksudkan menumbuhkembangkan kepribadian dan tanggung jawab siswa terhadap apa yang dikerjakan. Selain itu, kegiatan non-kurikuler juga dijadikan sebagai modal belajar berorganisasi dan kemandirian.